Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- serveurs:installation:db-srv:geonature-atlas-db [2020/02/13 14:40] – créée jpmilcent
+++ serveurs:installation:db-srv:geonature-atlas-db [2026/10/20 16:35] (Version actuelle) – jpmilcent
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-====== Installer GeoNature Atlas DB ======
+====== Installer la base de données GeoNature Atlas v2 ======
-  * **Préalable** : il est nécessaire d'avoir installé GeoNature Atlas sur le serveur Frontend et copié l'installation de GeoNature Atlas sur le serveur DB.
+  * **Préalable**, il est nécessaire d'avoir :
-  * Se connecter avec l'utilisateur //admin// et exécuter successivement les commandes suivantes : <code sql>
+    * [[ serveurs:installation:web-srv:geonature-atlas-app| installé GeoNature Atlas sur le serveur Frontend et copié l'installation de GeoNature Atlas sur le serveur DB]].
-psql
+    * transféré le dépôt "data" sur le serveur et réalisé l'installation du territoire
-\c geonature2db;
+      * Pour le SINP-PACA: [[database:sinp-paca:import-donnees#recuperation_en_local_du_depot_data_et_transfert_sur_le_serveur| transfert du dépôt "data"]] ; [[database:sinp-paca:import-donnees#ajoutcorrection_du_referentiel_geographique_dans_la_base_de_donnees_geonature| installation du territoire]]
+      * Pour le SINP-AURA: [[database:sinp-aura:import-donnees#recuperation_en_local_du_depot_data_et_transfert_sur_le_serveur| transfert du dépôt "data"]] ; [[database:sinp-aura:import-donnees#ajoutcorrection_du_referentiel_geographique_dans_la_base_de_donnees_geonature| installation du territoire]]
--- Donner les droits à l'utilisateur geonatatlas aux schémas de la base geonature2db
+  * Se connecter avec //geonat// à l'instance //pdb-srv// : ''%% ssh geonat@pdb-<region>-sinp %%''
-GRANT USAGE ON SCHEMA gn_synthese, ref_geo, ref_nomenclatures, taxonomie TO geonatatlas;
+  * À partir de la v2 de l'Atlas, s'il est nécessaire de filter les données de la ''synthese'' une vue ''gn_synthese.synthese_atlas'' peut être créée (renseigner le paramètre ''observation_data_source'' du fichier ''settings.ini'') :
-GRANT SELECT ON ALL TABLES IN SCHEMA gn_synthese, ref_geo, ref_nomenclatures, taxonomie TO geonatatlas;
+    * Utiliser par exemple : <code sql>
+ CREATE OR REPLACE VIEW gn_synthese.synthese_atlas AS
--- Supprimer les communes inutiles pour le SINP SUD-PACA :
+    SELECT
--- Résultats obtenus :
+        id_synthese,
--- UPDATE 33895 rows
+        the_geom_point,
--- Durée : 4333,858 ms (00:04,334)
+        id_nomenclature_sensitivity,
-UPDATE ref_geo.l_areas
+        id_nomenclature_observation_status,
-  SET enable = false
+        cd_nom,
-  WHERE id_type = 25
+        date_min,
-    AND id_area NOT in (
+        altitude_min,
-      SELECT a.id_area
+        altitude_max,
-      FROM ref_geo.l_areas AS a
+        observers,
-        JOIN ref_geo.li_municipalities AS m ON (a.id_area = m.id_area)
+        id_dataset
-      WHERE insee_dep in ('04', '05', '06', '13', '83', '84')
+    FROM gn_synthese.synthese
-    );
+    WHERE id_nomenclature_valid_status IN (
+            ref_nomenclatures.get_id_nomenclature('STATUT_VALID', '0'),
-\q
+            ref_nomenclatures.get_id_nomenclature('STATUT_VALID', '1'),
+            ref_nomenclatures.get_id_nomenclature('STATUT_VALID', '2')
+        )
+        OR id_nomenclature_valid_status IS NULL ;
 </code>
-  * Créer le territoire couvert par l'Atlas dans le schéma //ref_geo// de la base GeoNature :
+    * Normalement, chaque instance SINP devrait avoir un fichier SQL contenant ce code dans son dépôt ''sinp-<region>-data''
-    * Se placer à la racine du //home// de l'utilisateur //admin// : ''cd ~''
+  * Installer la base de données de //GeoNature Atlas// :
-    * Créer un dossier pour les téléchargements : ''mkdir dwl''
+    * Se placer dans le dossier racine de l'//Atlas// : ''%% cd ~/www/atlas/ %%''
-    * Créer un dossier pour les données : ''mkdir data''
+    * Lancer le script d'installation de la base de données :
-    * Se placer dans le dossier des téléchargements : ''cd ~/dwl''
+      * Se placer dans le dossier ''install/'' avec : ''cd install/''
-    * Télécharger [[https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/admin-express/|les contours administratifs français sur data.gouv.fr]] au format SHP : ''<nowiki>wget https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/r/4636895e-e64b-497c-a9bb-8cb49b75bd1a -O admin-express-cog_v2017-01-01.7z</nowiki>''
+      * Lancer l'installation : ''%% ./install_db.sh %%''
-    * Décompresser l'archive : '' p7zip -d admin-express-cog_v2017-01-01.7z ''
+      * Vérifier le bon déroulement de l'installation avec le fichier de log : ''%% tail -f ~/www/atlas/log/install_db.log %%''
-    * Se placer dans le dossier suivant : ''cd ADMIN-EXPRESS-COG_1-0__SHP__FRA_2017-06-19/ADMIN-EXPRESS-COG/1_DONNEES_LIVRAISON_2017-06-19/ADE-COG_1-0_SHP_LAMB93_FR/''
+    * Si l'application est déjà installée, penser à démarrer sur le serveur //web-srv// le service //atlas// : ''%% systemctl start geonature-atlas %%'' ou ''%% systemctl start geonature-atlas@geonat %%''
-    * Créer un fichier SQL des contours des régions française : '' shp2pgsql -c -D -s 2154 -I REGION ref_geo.tmp_region > ~/data/region.sql; ''
-    * Se connecter à la base : ''psql -h 10.0.1.20 -d geonature2db -U geonatadmin''
-    * Exécuter les commandes suivantes :<code sql>
-\i  /home/admin/data/region.sql
-INSERT INTO ref_geo.bib_areas_types (type_name, type_code, type_desc, ref_name, ref_version)
-VALUES ('Territoire SINP', 'SINP', 'Région PACA', 'IGN admin_express', 2017);
-INSERT INTO ref_geo.l_areas (id_type, area_name, area_code, geom, "enable")
-	SELECT ref_geo.get_id_area_type('SINP'), nom_reg, insee_reg, geom, TRUE
-	FROM ref_geo.tmp_region
-	WHERE insee_reg = '93';
-</code>
-  * Installer les dépendances du script d'installation de la base de données //Gdal// :
-    * ''sudo aptitude install -y python-gdal''
-    * ''sudo aptitude install -y gdal-bin''
-  * Installer la base de données de GeoNature Atlas :
-    * Se placer dans le dossier racine de l'Atlas : ''cd /home/geonat/www/atlas/''
-    * Lancer le script d'installation de la base de données : ''./install_db.sh''
-      * Si l'application est déjà installée, penser à démarrer sur le serveur Frontend le service atlas : ''supervisorctl start atlas''
-      * Vérifier le bon déroulement de l'installation avec le fichier de log : ''tail -f /home/geonat/www/atlas/log/install_db.log''
-    * Il est nécessaire de retourner sur l'instance web le fichier //territoire.json// créé par le script //install_db.sh// : ''scp -P <port-ssh-web-srv> territoire.json geonat@web-paca-sinp:/home/geonat/www/atlas/static/custom/''