Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
| procedures:recuperation_et_integration_de_donnees_depuis_le_gbif [2026/02/02 14:13] – [Étape intermédiaire iNaturalist] dmaillard | procedures:recuperation_et_integration_de_donnees_depuis_le_gbif [2026/02/03 07:59] (Version actuelle) – dmaillard | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 73: | Ligne 73: | ||
| } | } | ||
| } | } | ||
| + | |||
| + | Autres configurations : | ||
| + | * [[Configuration Musée des Confluences]] | ||
| + | * [[Configuration Observations.org]] | ||
| Ligne 171: | Ligne 175: | ||
| Ces id_inaturalist sont ensuite utilisés dans R, avec le script suivant, pour récupérer les uuids des données dans iNaturalist, | Ces id_inaturalist sont ensuite utilisés dans R, avec le script suivant, pour récupérer les uuids des données dans iNaturalist, | ||
| - | fetch_inat_uuid <- function( | + | |
| df, | df, | ||
| id_col = " | id_col = " | ||
| Ligne 178: | Ligne 182: | ||
| batch_size = 50, | batch_size = 50, | ||
| sleep_sec = 1 | sleep_sec = 1 | ||
| - | ) { | + | |
| | | ||
| library(httr) | library(httr) | ||
| Ligne 255: | Ligne 259: | ||
| | | ||
| return(df) | return(df) | ||
| - | } | + | |
| - | inaturalist_uuids <- fetch_inat_uuid( | + | |
| - | inaturalist_ids, | + | inaturalist_ids, |
| - | id_col | + | id_col |
| - | uuid_col = " | + | uuid_col = " |
| - | batch_size = 50, | + | batch_size = 50, |
| - | sleep_sec = 1 | + | sleep_sec = 1 |
| - | ) | + | ) |
| + | |||
| + | Ces résultats sont ensuite exportés de R, importés dans la base de données postgresql dans une table pinv_gbif.cor_uuid_inaturalist, | ||
| + | | ||
| ==== Postgresql : Insérer ou actualiser les données en synthèse ==== | ==== Postgresql : Insérer ou actualiser les données en synthèse ==== | ||
dmaillard